台州市公共卫生医学中心承担台州市重点传染病防治指导工作,为台州市耐多药结核诊治定点医院,突发传染病定点诊治医院,在埃博拉病、人感染H7N9禽流感、中东呼吸综合征等防治中贡献突出。同时感染科在发热待查、颅内感染、自身免疫性肝病、乙丙肝诊治等方面形成了自己的特色,经验丰富。