1943年3月,临海霍乱流行,县政府设“临时时疫医院”于城关后岭殿,陈省几任院长。
1949年,开始收治伤寒、乙脑、肺结核等传染病人,从属于大内科。周文达、王家驹临床诊断临海县首例、国内第二例钩端螺旋体病。
1952年4月设“传染病隔离科室”,有床位12张。
1954年成功从病人脑脊液培养出钩端螺旋体,证实了出血性黄疸钩端螺旋体病病原体。
1962年3月,从大内科中分出,专设传染病科。
1963年11月,设立肠道专科门诊。
1977年,《钩端螺旋体病的发现及国内首次培养成功》科研项目获全国首届科技大会三等奖。
1979年6月,传染科、检验科科研小组获“浙江省劳动模范集体”称号。
1988年3月,甲型肝炎在临海地区暴发流行,积极开展病人临床诊治,并自制“优安净”洗消液用于消毒预防。
1998年,收治台州首例艾滋病病人。
2001年,被浙江省卫生厅确定为艾滋病临床诊治指导医院。列入台州市第一轮医学重点学科建设
2002年,课题《急性肝衰竭大鼠内毒素血症防治研究》获省卫生科技创新二等奖、省科技进步三等奖
2003年,列入温州医学院医学重点学科建设。4月,全国出现非典型肺炎疫情,被省卫生厅确定为全省13家非典病人收治定点医院之一。7月被浙江省卫生厅批准为首批开展人工肝支持系统临床应用的医院
2004年,确定为温州医学院研究生临床培养基地。5月,临海等地发生病毒性脑膜炎暴发疫情,经脑脊液病毒分离证实为埃可病毒30型引起,同时启动《埃可病毒30型病脑的临床和控制研究》,较好地控制了疫情,课题被列入省科技计划重大项目。5月,台州市卫生局批准设立台州市人工肝治疗中心。
2007年,台州出现手足口病疫情,设立手足口病专病门诊及隔离病区
2008年,课题《TGF-β基因多态性与肝纤维化关系研究》获省卫生科技创新三等奖。
2009年,全球出现甲流疫情,收治重症甲流病人并成功应用甲流患者恢复期血清抢救成功重症甲流孕妇。
2011年,课题《急性肝衰竭大鼠胃肠损害的系列研究》获省卫生科技创新二等奖。确诊浙江省首例发热伴血小板减少综合征病人,并开展了流行病学及临床研究。
2012年,学科获得药物临床试验资格认定。课题《基于蛋白组学技术筛选肝衰竭早期诊断标志物》列入省重大科技专项。
2012年12月,台州市公共卫生医学中心试运行。
2013年,开始成为台州市耐多药肺结核定点诊治医院。
2013年,成为台州市人感染H7N9定点诊治医院。
2014年,学科列入浙江省区域专病中心建设。
2014年,开始成为台州市埃博拉病定点诊治医院。
2014年11月,正式成立台州市感染病医院。
2016年,开始成为台州市艾滋病定点诊治医院。
2016年10月,学科列入台州市重点学科(支撑学科)建设。